Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms