Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC4Q5GLZ8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms