Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KHDC3LQ587J8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KHDC3LQ587J8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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