Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIN52Q52LA3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms