Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms