Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP21-1Q3LI58 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP21-1Q3LI58 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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