Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PDK4Q16654 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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