Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms