Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms