Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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