Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms