Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms