Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms