Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms