Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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