Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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