Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMS2P11Q13670 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms