Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NAE1Q13564 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms