Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UBE2V1Q13404 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms