Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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