Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP3K1Q13233 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms