Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms