Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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