Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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