Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms