Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms