Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms