Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms