Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms