Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPCQ01831 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms