Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms