Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARF3P61204 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARF3P61204 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms