Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPCS3P61009 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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