Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms