Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA9P57773 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms