Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms