Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms