Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms