Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms