Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPS1P31327 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms