Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms