Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5F1P24539 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms