Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms