Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ME2P23368 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ME2P23368 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ME2P23368 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms