Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGCP20142 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGCP20142 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGCP20142 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGCP20142 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGCP20142 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGCP20142 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGCP20142 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGCP20142 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGCP20142 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms