Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms