Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL7RP16871 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms