Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms