Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT13P13646 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT13P13646 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms