Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX4I1P13073 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms